Es wurde festgestellt, dass mehrere leitende Beamte der Innosuisse, der Schweizerischen Bundesagentur für Innovation, direkt oder indirekt von öffentlichen Mitteln für Geschäftsprojekte und Forschungsinitiativen profitiert haben. Laut Berichten des Schweizerischen öffentlichen Rundfunks RTS, die Dokumente im Rahmen der Informationsfreiheitsgesetze erhalten haben, wurden mehrere Fälle aufgedeckt, in denen Personen, die mit der Führung der Innosuisse verbunden sind, finanzielle Unterstützung durch mit ihnen verbundene Unternehmen erhalten haben.
Daten aus der Bundesdatenbank Aramis zeigen, dass etwa zwanzig Zahlungen an Unternehmen geleistet wurden, die mit Personen verbunden sind, die in den Leitungsgremien der Innosuisse tätig sind. Laut RTS haben Mitglieder der Innosuisse auf verschiedene Weise profitiert, auch durch ihre verbundenen Unternehmen, die staatliche Mittel erhalten. Innosuisse räumt ein, dass solche Situationen auftreten können, und erklärt, dass die Mitglieder des Innovationsrats bewusst aus dem Innovationssektor rekrutiert werden, um praktische Erfahrung zu sammeln. Die Agentur stellt auch fest, dass einige Zuschüsse nicht an private Unternehmen gerichtet sind, sondern an akademische Partner, die an gemeinsamen Forschungsprojekten teilnehmen.
Die Agentur betont ihre Interessenkonflikt-Regeln und erklärt, dass jeder, der an einem Förderantrag beteiligt ist, seine Verbindung offenlegen, sich vom Bewertungsverfahren zurückziehen und sich von der Teilnahme an der Entscheidungsfindung enthalten muss.
Yves Gingras, Soziologe an der Universität von Quebec in Montreal und Experte für Forschungsbewertung, argumentiert, dass diese Maßnahmen möglicherweise nicht ausreichen, um Interessenkonflikte zu verhindern. Er kritisiert die Praxis, nur drei bis fünf Personen zu erlauben, über Förderanträge zu entscheiden, und nennt es den schlimmstmstmöglichen Ansatz. Er hebt Bedenken hervor, wenn Mitglieder dieser Entscheidungsträgergruppen gleichzeitig für die Finanzierung ihrer eigenen Unternehmen beantragen, was möglicherweise die Wahrnehmung von Vorurteilen verstärkt. Ein weiteres bemerkenswertes Beispiel betrifft André Kudelski, Präsident von Innosuisse, der auch im Vorstand von Montreux Media Ventures tätig ist. Dieses Unternehmen erhielt 440.000 Schweizer Franken an Subventionen von Innosuisse.
Die Innosuisse arbeitet unter der Federverwaltung für Wirtschaft, Bildung und Forschung (WBF) unter der Leitung von Bundesrat Guy Parmelin. Die Abteilung ernennt den Verwaltungsrat der Innosuisse und legt strategische Ziele fest. Auf Anfrage des RTS erklärte der WBF, dass er die täglichen Abläufe der Innosuisse nicht überwacht. Stattdessen liegt die Verantwortung für die Aufsicht bei der Innosuisse selbst, die diese Rolle teilweise an das Bundesprüfungsamt delegiert.
Die Rechnungsprüfungsstelle stellt jedoch klar, dass sie nur prüft, ob geeignete Kontrollmechanismen vorhanden sind, anstatt die Einhaltung aktiv zu überwachen. Die Enthüllungen haben eine Debatte über die Wirksamkeit der derzeitigen Schutzmaßnahmen gegen Interessenkonflikte innerhalb von Innosuisse ausgelöst. Kritiker argumentieren, dass zwar formelle Verfahren vorhanden sind, sie jedoch potenzielle Vorurteile in Entscheidungsprozessen möglicherweise nicht angemessen angehen.
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